Navegando entre os Foruns da vida, decobri outra maneira bem fácil:
Abrir o FireFox > Favoritos > Organizar favoritos... (Ctrl+Shif+B) > Importar e backup > Exportar HTML. Salve com o nome que desejar e na pasta que desejar. Uma dica, crie uma pasta em Meus documentos.
Em seguida É só abrir o novo FireFox do outro HD, repetir o mesmo processo. A diferença é que em vez de escolher a opção EXPORTAR, deverá escolher IMPORTAR HTML.
Pronto! Todos os favoritos que outrora estava no antigo HD agora está no outro.
Fonte:
http://forum.clubedohardware.com.br/salvar-favoritos-firefox/441422?p=2248955